MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 100207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019950	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
2	NC_019950	CAC	2	6	247	252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
3	NC_019950	GTC	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
4	NC_019950	GAC	2	6	299	304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
5	NC_019950	CAG	2	6	310	315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
6	NC_019950	TCG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
7	NC_019950	AGC	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
8	NC_019950	GCC	2	6	480	485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
9	NC_019950	CCG	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
10	NC_019950	CGAC	2	8	531	538	25 %	0 %	25 %	50 %	433625089
11	NC_019950	CGA	2	6	544	549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
12	NC_019950	GCC	2	6	559	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
13	NC_019950	ACG	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
14	NC_019950	TGA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625089
15	NC_019950	CGTT	2	8	747	754	0 %	50 %	25 %	25 %	433625089
16	NC_019950	CGC	3	9	781	789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
17	NC_019950	CCCG	2	8	809	816	0 %	0 %	25 %	75 %	433625089
18	NC_019950	AC	3	6	863	868	50 %	0 %	0 %	50 %	433625089
19	NC_019950	GGCA	2	8	880	887	25 %	0 %	50 %	25 %	433625089
20	NC_019950	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625089
21	NC_019950	CGA	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
22	NC_019950	TTC	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625089
23	NC_019950	CAA	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625089
24	NC_019950	TCATC	2	10	1122	1131	20 %	40 %	0 %	40 %	433625089
25	NC_019950	CCCA	2	8	1138	1145	25 %	0 %	0 %	75 %	433625089
26	NC_019950	AGC	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
27	NC_019950	ACC	2	6	1213	1218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
28	NC_019950	CGA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
29	NC_019950	CAG	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
30	NC_019950	GC	3	6	1341	1346	0 %	0 %	50 %	50 %	433625089
31	NC_019950	GCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625089
32	NC_019950	CCG	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
33	NC_019950	CA	3	6	1628	1633	50 %	0 %	0 %	50 %	433625089
34	NC_019950	CAC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
35	NC_019950	CGG	2	6	1825	1830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625090
36	NC_019950	AAGG	2	8	1849	1856	50 %	0 %	50 %	0 %	433625090
37	NC_019950	CAGG	2	8	1947	1954	25 %	0 %	50 %	25 %	433625090
38	NC_019950	GC	3	6	1959	1964	0 %	0 %	50 %	50 %	433625090
39	NC_019950	GGT	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625090
40	NC_019950	GGC	2	6	1982	1987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625090
41	NC_019950	TGCG	2	8	2021	2028	0 %	25 %	50 %	25 %	433625090
42	NC_019950	GGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
43	NC_019950	GCG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
44	NC_019950	CGC	2	6	2406	2411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625091
45	NC_019950	CGGCA	2	10	2412	2421	20 %	0 %	40 %	40 %	433625091
46	NC_019950	CG	3	6	2441	2446	0 %	0 %	50 %	50 %	433625091
47	NC_019950	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625091
48	NC_019950	CG	3	6	2482	2487	0 %	0 %	50 %	50 %	433625091
49	NC_019950	ACC	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625091
50	NC_019950	TGGG	2	8	2505	2512	0 %	25 %	75 %	0 %	433625091
51	NC_019950	CGG	2	6	2580	2585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
52	NC_019950	GCGG	2	8	2630	2637	0 %	0 %	75 %	25 %	433625091
53	NC_019950	GCG	2	6	2662	2667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
54	NC_019950	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625091
55	NC_019950	CAA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625091
56	NC_019950	CA	3	6	2856	2861	50 %	0 %	0 %	50 %	433625091
57	NC_019950	CGC	2	6	2885	2890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625091
58	NC_019950	CGA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625091
59	NC_019950	CAA	2	6	2973	2978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625091
60	NC_019950	GGC	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
61	NC_019950	AGC	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625092
62	NC_019950	CCA	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625092
63	NC_019950	A	7	7	3308	3314	100 %	0 %	0 %	0 %	433625092
64	NC_019950	TC	4	8	3317	3324	0 %	50 %	0 %	50 %	433625092
65	NC_019950	CGG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625092
66	NC_019950	AC	4	8	3441	3448	50 %	0 %	0 %	50 %	433625092
67	NC_019950	CCGA	2	8	3480	3487	25 %	0 %	25 %	50 %	433625092
68	NC_019950	CGTTT	2	10	3847	3856	0 %	60 %	20 %	20 %	433625093
69	NC_019950	GTGG	2	8	3887	3894	0 %	25 %	75 %	0 %	433625093
70	NC_019950	GCCA	2	8	3905	3912	25 %	0 %	25 %	50 %	433625093
71	NC_019950	CGGTGC	2	12	3919	3930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433625093
72	NC_019950	GTT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
73	NC_019950	CCG	2	6	3997	4002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
74	NC_019950	TTG	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
75	NC_019950	CGA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
76	NC_019950	TTG	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
77	NC_019950	ATT	2	6	4232	4237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433625093
78	NC_019950	TCAG	2	8	4249	4256	25 %	25 %	25 %	25 %	433625093
79	NC_019950	CGC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
80	NC_019950	GAC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
81	NC_019950	GGT	2	6	4331	4336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625093
82	NC_019950	CGT	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625093
83	NC_019950	GCC	2	6	4446	4451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
84	NC_019950	CGG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625093
85	NC_019950	CGTT	2	8	4475	4482	0 %	50 %	25 %	25 %	433625093
86	NC_019950	GCA	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
87	NC_019950	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625093
88	NC_019950	ACCG	2	8	4601	4608	25 %	0 %	25 %	50 %	433625093
89	NC_019950	AC	3	6	4610	4615	50 %	0 %	0 %	50 %	433625093
90	NC_019950	CCA	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625093
91	NC_019950	GC	3	6	4687	4692	0 %	0 %	50 %	50 %	433625093
92	NC_019950	TGA	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625093
93	NC_019950	ACGG	2	8	4827	4834	25 %	0 %	50 %	25 %	433625093
94	NC_019950	CGG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625093
95	NC_019950	CGGTT	2	10	4996	5005	0 %	40 %	40 %	20 %	433625093
96	NC_019950	CGTC	2	8	5041	5048	0 %	25 %	25 %	50 %	433625094
97	NC_019950	GGTA	2	8	5221	5228	25 %	25 %	50 %	0 %	433625094
98	NC_019950	GTG	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
99	NC_019950	ACG	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
100	NC_019950	CGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
101	NC_019950	CAA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625094
102	NC_019950	TGT	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625094
103	NC_019950	GGTT	2	8	5403	5410	0 %	50 %	50 %	0 %	433625094
104	NC_019950	CGG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
105	NC_019950	GAT	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625094
106	NC_019950	GT	3	6	5568	5573	0 %	50 %	50 %	0 %	433625094
107	NC_019950	TGG	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
108	NC_019950	CCGC	2	8	5631	5638	0 %	0 %	25 %	75 %	433625094
109	NC_019950	GAA	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625094
110	NC_019950	AGC	2	6	5785	5790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
111	NC_019950	CGG	2	6	5799	5804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
112	NC_019950	GGC	2	6	5809	5814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
113	NC_019950	GAC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
114	NC_019950	GGC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
115	NC_019950	TGG	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
116	NC_019950	GTT	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625094
117	NC_019950	CGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
118	NC_019950	CGG	2	6	6057	6062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
119	NC_019950	CCG	2	6	6069	6074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
120	NC_019950	CCG	2	6	6114	6119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
121	NC_019950	GGT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
122	NC_019950	TGC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625095
123	NC_019950	CG	5	10	6298	6307	0 %	0 %	50 %	50 %	433625095
124	NC_019950	GTCGG	2	10	6345	6354	0 %	20 %	60 %	20 %	433625095
125	NC_019950	CGA	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625095
126	NC_019950	GGT	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625095
127	NC_019950	CCA	2	6	6510	6515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625095
128	NC_019950	ACG	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625095
129	NC_019950	CGC	2	6	6633	6638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625095
130	NC_019950	CGG	2	6	6683	6688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625095
131	NC_019950	CG	3	6	6734	6739	0 %	0 %	50 %	50 %	433625095
132	NC_019950	AAG	2	6	7011	7016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625096
133	NC_019950	GGT	2	6	7139	7144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
134	NC_019950	CGA	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
135	NC_019950	TGC	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625096
136	NC_019950	CGA	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
137	NC_019950	CCAC	2	8	7255	7262	25 %	0 %	0 %	75 %	433625096
138	NC_019950	ACCG	2	8	7274	7281	25 %	0 %	25 %	50 %	433625096
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140	NC_019950	CGG	2	6	7310	7315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625096
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142	NC_019950	CGGCGT	2	12	7358	7369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433625096
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163	NC_019950	ATC	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625096
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246	NC_019950	CAGAC	2	10	11555	11564	40 %	0 %	20 %	40 %	433625097
247	NC_019950	CGC	2	6	11744	11749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625098
248	NC_019950	TGC	2	6	11760	11765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625098
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250	NC_019950	GCC	3	9	11796	11804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625098
251	NC_019950	CCCG	2	8	11835	11842	0 %	0 %	25 %	75 %	433625098
252	NC_019950	CCG	4	12	11840	11851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625098
253	NC_019950	GCC	2	6	11905	11910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625098
254	NC_019950	C	6	6	11965	11970	0 %	0 %	0 %	100 %	433625098
255	NC_019950	CCGGC	2	10	12005	12014	0 %	0 %	40 %	60 %	433625098
256	NC_019950	CGCAA	2	10	12026	12035	40 %	0 %	20 %	40 %	433625098
257	NC_019950	GCC	2	6	12088	12093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625098
258	NC_019950	GCG	2	6	12101	12106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625098
259	NC_019950	CGGCG	2	10	12152	12161	0 %	0 %	60 %	40 %	433625098
260	NC_019950	TTC	2	6	12253	12258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625098
261	NC_019950	GAT	2	6	12264	12269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625098
262	NC_019950	CGG	2	6	12297	12302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625098
263	NC_019950	AAC	2	6	12349	12354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625098
264	NC_019950	GCA	2	6	12362	12367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625098
265	NC_019950	CGG	2	6	12399	12404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625098
266	NC_019950	TGA	2	6	12437	12442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625098
267	NC_019950	CCA	2	6	12452	12457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625098
268	NC_019950	CGG	2	6	12495	12500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625098
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294	NC_019950	CCCG	2	8	15150	15157	0 %	0 %	25 %	75 %	433625101
295	NC_019950	TGC	2	6	15254	15259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625101
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298	NC_019950	ACCTTC	2	12	15622	15633	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	433625102
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302	NC_019950	TGCT	2	8	15885	15892	0 %	50 %	25 %	25 %	433625103
303	NC_019950	GCT	3	9	15899	15907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625103
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381	NC_019950	GGT	3	9	19329	19337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625106
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384	NC_019950	TGA	2	6	19385	19390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625106
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387	NC_019950	AGC	2	6	19444	19449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625106
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389	NC_019950	ACC	2	6	19491	19496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625106
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494	NC_019950	TCA	2	6	23948	23953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625109
495	NC_019950	ACC	2	6	23996	24001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625109
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497	NC_019950	CGGC	2	8	24076	24083	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
498	NC_019950	GTC	3	9	24108	24116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
499	NC_019950	CGTAGT	2	12	24155	24166	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433625109
500	NC_019950	CGA	2	6	24167	24172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109

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